Il est dirigé par un comité syndical élu pour six ans, composé de délégués des six communes désignés par les conseils municipaux.
Chaque commune est représentée proportionnellement à sa population.
Son renouvellement intervient en même temps que celui des conseils municipaux.
Le SAN du Val Maubuée est présidé depuis 1997 par Michel Ricart, maire de Lognes.